近未来某一年,地球爆发毁灭性极大的致命病毒,从而导致全球超过半数的人口死亡。一望无际的茫茫大海,似乎成为病毒无法涉足的神域,而汤姆·坎德勒船长(埃里克·迪恩 Eric Dane 饰)所统领的阿利·伯克级驱逐舰导弹驱逐舰“内森-詹姆斯”号,则成为天罚过后漫无目的漂流并等待 赦免的诺亚方舟。为了保存有生力量,同时确保船上的两名滤过性病原体学者研制出抗毒解药,坎德勒船长违抗了美国临时政府的召唤,带着船员踏上漫漫征途。然而一路上凶险倍至,为了补给和疫苗,他们不得不停靠港口和陆地,除此之外更有他国的船舰试图抢夺解药
男孩托马斯(迪伦·欧布莱恩 Dylan O'Brien 饰)在电梯中醒来,奇怪的是他除了名字之外什么都记不得。当电梯打开,他来到了一个陌生的地方“林间空地”。这里四周被高大的石头墙包围着,墙内住着许多男孩,有纽特(托马斯·桑斯特 Thomas Sangster 饰)、查克(布雷克·库珀 Blake Cooper 饰)、米诺(李基弘 Ki Hong Lee 饰)等人,他们都被困在迷宫里,而墙外还有一群巨大的怪兽威胁着。一天,电梯为他们送来了一个女孩特雷莎(卡雅·斯考达里奥 Kaya