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15世纪欧洲的某个国家，有一位跳级被大学录取的神童拉法尔。因为周围的期待，他宣布要进修当时被认为最为重要的学问“神学”。但是，对于一直都热心投入的天文学，他也难以舍弃。某一天，他遇到了一个叫休伯特的神秘学者。据说休伯特因为接触到了基于异端思想的禁忌研究，被关进过监狱。而他研究的，是和宇宙有关的，冲击力十足的“某个假说”——